Каква е разликата между 16s rRNA и 18s RRNA?
Каква е разликата между 16s rRNA и 18s RRNA?

Видео: Каква е разликата между 16s rRNA и 18s RRNA?

Видео: Каква е разликата между 16s rRNA и 18s RRNA?
Видео: РНК структура, типы и функции 2024, Ноември
Anonim

Основното разлика между извършване на анализи с 18S рРНК генни данни вместо 16S рРНК генните данни (или ITS данни) са референтната база данни, използвана за избор на OTU, таксономичните присвоения и изграждането на подравняване, базирано на шаблон, тъй като трябва да съдържа еукариотни последователности.

Имайки предвид това, защо 16s rRNA генът се използва за идентификация?

В 16S рибозомна РНК ген кодира РНК компонента на 30S субединицата на бактериалната рибозома. Поради сложността на ДНК-ДНК хибридизация, 16S rRNA ген секвенирането е използван като инструмент за идентифицират бактерии на видово ниво и подпомагат диференцирането между тясно свързани бактериални видове [8].

Освен това, имат ли еукариотите 16s rRNA? В 16S рРНК генът присъства във всички бактерии и свързана форма се среща във всички клетки, включително тези на еукариоти.

Също така въпросът е какво е 18s и 28s rRNA?

В 28S / 18S рибозомна РНК Съотношението често се използва за оценка на качеството на общата РНК, пречистена от всяка дадена проба. при хората, 28S рРНК има ~5070 нуклеотида и 18S има 1869 нуклеотида, което дава a 28S / 18S съотношение от ~2,7. Висока 28S / 18S съотношението е индикация, че пречистената РНК е непокътната и не се е разградила.

Какво представлява секвенирането на 16s rRNA?

16S рРНК ген последователност анализът е стандартен метод в бактериалната таксономия и идентификация и се основава на откриването на последователност разлики (полиморфизми) в хиперпроменливите области на 16S рРНК ген, който присъства във всички бактерии.

Препоръчано: