Как се изчислява резултатът за подравняване?
Как се изчислява резултатът за подравняване?

Видео: Как се изчислява резултатът за подравняване?

Видео: Как се изчислява резултатът за подравняване?
Видео: Защо в Excel виждам само формулите, не и резултата? Excel уроци от Аула 2024, Ноември
Anonim

В резултат на подравняване , С, изчислено като сума от заместване и празнина резултати . Заместване резултати са дадени от справочна таблица (виж PAM, BLOSUM). празнина резултати са обикновено изчислено като сбор от G, наказанието за откриване на празнина и L, наказанието за удължаване на празнината. За празнина с дължина n цената на празнината ще бъде G+Ln.

Съответно какво е резултатът за подравняване?

Оптимално подравняване и резултат за подравняване Оптимално подравняване е подравняване давайки най-високото резултат , и резултат за подравняване това е най-високо резултат . Това е резултат за подравняване на X и Y = the резултат на X и Y при оптимално подравняване . Например, на резултат за подравняване от следните X и Y е 36.

Освен по-горе, как работи подравняването на последователността? В биоинформатиката а подравняване на последователността е начин за подреждане на последователности на ДНК, РНК или протеин за идентифициране на региони на сходство, които могат да бъдат следствие от функционални, структурни или еволюционни връзки между последователности.

Оттук нататък какъв е резултатът в биоинформатиката?

В контекста на подравняването на последователности, a резултат е числова стойност, която описва цялостното качество на подравняването. По-високите числа съответстват на по-високо сходство. В резултат мащабът зависи от точкуване използвана система (матрица за заместване, наказание за пропуски).

Какво е оптимално подравняване при подравняване на последователността?

В оптимално подравняване от два протеина последователности е подравняване което максимизира сумата от точки по двойки минус всякакво наказание за въведени пропуски. Динамичното програмиране позволява оптимално подравняване от две последователности се намира в от порядъка на mns стъпки, където m и n са дължините на последователности.

Препоръчано: