Видео: Как се сглобяват контигите в скелета?
2024 Автор: Miles Stephen | [email protected]. Последно модифициран: 2023-12-15 23:33
При създаването на проект на геном индивидуалните разчитания на ДНК са на първо място събрани в контиги , което по естеството на своите сглобяване , има празнини между тях. Следващата стъпка е да се след това преодолете празнините между тях контиги към създавам скеле . Това може да бъде направено с помощта на оптично картографиране или секвениране на сдвоени двойки.
По същия начин, може да попитате какво представляват контигите и скелетите?
А скеле е част от геномната последователност, реконструирана от крайни секвенирани клонинги на пушки с цял геном. Скелета са съставени от контиги и пропуски. А contig е непрекъсната дължина на геномна последователност, в която редът на базите е известен с високо ниво на доверие. В някои случаи, скелета може да се припокрива.
Също така, какво е contigs в биоинформатиката? А contig (от съседен) е набор от припокриващи се ДНК сегменти, които заедно представляват консенсусен регион на ДНК. Контиги по този начин може да се отнася както до припокриваща се ДНК последователност, така и до припокриващи се физически сегменти (фрагменти), съдържащи се в клонинги в зависимост от контекста.
В тази връзка как се сглобяват контигите?
Наборът от припокриваща се ДНК последователност от ДНК фрагменти е известен като a contig . Contig картографирането е процес, чрез който се припокриват клонинги сглобени да последователно това припокриване. Това включва подреждане на контиги в ред и ориентация. Клониране контиги може да бъде автоматично сглобени използвайки техните BAC-крайни последователности.
Защо контигите са важни?
Contig сглобяването е важно стъпка в сглобяването на генома. За картографиране се сглобяват припокриващи се клонинги, за да се последователно припокриват. Всеки фрагмент се клонира във вектор и се секвенира от двата края, за да се получи дължина на последователността от приблизително 600-700 bp. Последователността от двата края на ДНК фрагмента се нарича двоен край.
Препоръчано:
Как се предвижда дали дадена реакция е ендотермична или екзотермична?
Ако енергийното ниво на реагентите е по-високо от енергийното ниво на продуктите, реакцията е екзотермична (енергията е била освободена по време на реакцията). Ако енергийното ниво на продуктите е по-високо от енергийното ниво на реагентите, това е ендотермична реакция
Как се грижите за кедрово дърво?
Поливайте редовно малките дървета и ги оставяйте да изсъхнат напълно между всяко поливане. Като цяло торът не е необходим, освен ако почвата не е много нездравословна. След като дървото е узряло, грижата за кедрово дърво включва малко повече от редовно мулчиране и отстраняване на мъртви или болни клони
Как органичните съединения са получили името си Как думата е свързана със значението й?
Как думата е свързана със значението си? Органичните съединения получават името си от броя на въглеродните връзки. Думата е свързана със значението, защото има отношение към връзките във въглеродните атоми в органичните съединения
Как изглеждаше ДНК, свързвайки химическата си структура с това как изглежда, когато голяма част от нея е събрана заедно?
Свържете химическата му структура с това как изглежда, когато много от него са събрани заедно. ДНК изглеждаше като паяжина. ДНК беше разтворима в буфера за извличане на ДНК, така че не можехме да я видим. Когато се разбърква в етанола, се слепва и образува все по-дебели и по-дебели нишки, достатъчно големи, за да се видят
В каква посока се сглобяват нуклеиновите киселини?
Целият синтез на РНК и ДНК, както клетъчен, така и вирусен, протича в една и съща химическа посока: от 5' (фосфатен) край до 3' (хидроксил) край (виж Фигура 4-13). Веригите на нуклеиновите киселини са сглобени от 5' трифосфати на рибонуклеозиди или дезоксирибонуклеозиди